1、理想的清洁工具及清洁液的配制
清洁工具包括吹气球，清洁液，棉花与软木棍，擦镜纸，软纱布，放大镜(可用目镜代用)。
清洁溶液为分析纯酒精，分析纯。其中，无水乙醇占30%、占70%。
考虑到容易挥发，造成混合液比例改变，影响清洁效果，所以现配现用。不推荐用1**%*和二甲苯。因为1**%*清洁后容易留下痕迹，二甲苯不仅容易留下痕迹，而且对镀膜的伤害较大。
2、光学部件的擦拭方向及清洁步骤
擦拭透镜前一定要先除去灰尘沙砾，以免使镜划起沟纹影响使用效果。先用吹气球或者吹气吹掉表面的尘土颗粒，结合软毛刷轻轻吹刷，然后再用擦镜纸醮取清洁液进行擦拭。
3、光学部件的维护
①生物显微镜光路污染判断
当生物显微镜光源开启时，将高倍物镜转入光路，放上标本聚焦，将聚光镜的孔径光澜关小，再移开标本，通过目镜观察，光路中的污点将出现。这些污点可能存在于以下光学部件，目镜、物镜、观察筒、或者一些中间光学组件中。可以单独旋转目镜或者物镜来判断污点，当单独旋转目镜或者物镜时，污点转动，那么污点是在目镜或者物镜上，此时我们可以进一步拆卸目镜和物镜进行检查并清除。如果转动目镜和物镜时，污点不动，那么污点可能在观察筒和中间光学组件中，此时我们可以转动观察筒来判断，同样我们也能找出污点所在并清除。
②目镜和物镜表面脏物检查
拆下目镜，逆着光的方向并不断改变观察角度，可以清楚地看到物镜表面是否有污物。
当物镜有污物时，由于物镜顶端的透镜很小，往往肉眼很难分辨，可以拆卸一个目镜，调转一个方向则可当成放大镜使用，通过放大以后，物镜表面的污点将清晰可辨，然后清除。
③霉菌检查
温度为20~30℃，湿度为80~90%是Z适于透镜表面生长霉菌的条件。生物显微镜的光学表面都有防霉系统。一般有效期大约在5~6年左右(恶劣环境下3年)，超过6年以后，防霉系统会失效。此时，应该重新放置防霉片，否则，实验室条件差的生物显微镜会开始长霉。霉菌会分泌有害物质腐蚀玻璃表层的镀膜层，霉菌密度大时危害特别大，这样会严重危害生物显微镜的光学性能。
生物显微镜光路出现霉菌时，应该尽早除霉并更新防霉系统，安放防霉片，否则霉菌将会越长越历害，Z终导致光学部件脱膜。当霉菌出现时，常规的清洁液(酒精和混合液)将无法去除，此时需要专门的除霉膏才能*清除。
4、机械部件
在生物显微镜日常使用中还会遇到载物台下滑现象，以及无法成像等现象，这些问题，如果了解生物显微镜的机械构造的话，那么就容易解决了。载物台下滑问题，都有粗调松紧度调节钮，只要适当调节就能解决问题。如果通过此调节没法解决，那么调焦机械部分有可能损坏。
由于大部分生物显微镜有保护标本和镜头的Zgao限位装置，所以在使用时容易疏忽该限位装置，造成生物显微镜无法成像。
5、电路部件
生物显微镜还有很多电路部件，例如灯泡、电路板、保险丝等。日常使用中，灯泡是消耗品，当烧坏时，需要更换灯泡，一般看看生物显微镜说明书，就可以进行更换和对中调节。但是当更换灯泡时需要注意，不同型号的生物显微镜的灯泡的规格和功率不一样，当安装上规格不一致的灯泡时，会导致灯泡烧坏或者电路板烧坏。顺便提醒一下，在更换灯泡时，首先要*切断电源，其次手指不要接触灯泡，因为手指有油脂，会在灯泡上留有油脂指纹，时间长了会累积灰尘，当灯泡累积了灰尘后，长时间开启不宜于灯泡散热，这样会减短灯泡的寿命。
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